Αυτο που αναφερεις μπορει να εχει 2 αιτιες:
1) Αφου η καρτα ειναι μητρικη, θα εχει jacks για εισοδους. Αρα σιγουρα θα βαζεις καποιο μετατροπεα για να συνδεεις το μπασο. Πολλες φορες αυτοι οι μετατροπεις ειναι μετριοι ποιοτικα, ενω αλλες δεν κανουν καλη επαφη με το βυσμα που μετατρεπουν και το αποτελεσμα ειναι αυτος ο ηχος που ακους!
2) Κανονικα πρεπει να συνδεσεις το μπασο στο line in της καρτας κι οχι στο MIC IN. Οπως και να εχει "παρασιτα" δημιουργουνται ακομα κι οταν η σταθμη εισοδου της καρτας ειναι αρκετα υψηλη κι ετσι το σημα παραμορφωνεται πλεον λογω του "καψιματος" του καναλιου. Δοκιμασε να χαμηλωσεις μεσα απο τις ρυθμισεις της καρτας σου το line in της και δοκιμασε να γραψεις ξανα ;)
Εαν εχεις το προνομιο να αγορασεις μια εξωτερικη καρτα ηχου της ταξης των 100-150Ε, τοτε θα λυσεις το προβλημα σου σιγουρα! Κι επειδη το μπασο ειναι ενα ιδιαιτερο οργανο ( συχνοτικα ) θα σου προτεινα τη λυση της αγορας καρτας ηχου